翻堆能使堆肥腐熟一致、能為微生物的繁殖提供氧氣、并將堆肥產生的熱量散發出來中，有利于堆肥的腐熟。當堆溫度上升到60°C以上，保持48小時后開始翻堆（當溫度超過70°c時，須立即翻堆），翻堆要翻得徹底均勾，同時通過堆肥的腐熟程度確 定翻堆次數。
大多數微生物是好氧微生物，要保證堆肥中微生 物的生長。必須將堆肥的含氧量在5% -15%。堆肥的含氧主要由通風實現，傳統堆肥通風是通 過翻堆和攪拌來保證；不同的生產廠家也可以通過選擇不同的堆肥發酵方式來達到通風的目的。